segunda-feira, 27 de abril de 2020

Modelos do comportamento do Coronavirus gerador da doença Covid-19 nos municípios de Benjamin Constant e Tabatinga


Modelos do comportamento do Coronavirus gerador da doença Covid-19 nos municípios de Benjamin Constant e Tabatinga
Amazonas, Brasil





Uma característica importante dos vírus e outros patógenos é como eles são contagiosos (S. Cobey, Science 10.1126/science. abb5659 (2020). Isso é medido de algumas maneiras. Uma medida importante é o R0, ou número básico de reprodução, que indica quantos novos casos uma pessoa infectada gera. Para um R0 de três, esperaríamos que cada novo caso de uma doença produzisse três outras infecções. Esta não é apenas uma medida da infecciosidade inerente a uma doença. Também depende de outros fatores, incluindo a taxa de contato dentro de uma população e a duração do período infeccioso. É um valor dependente da situação; portanto, em uma cidade, o R0 pode ser maior e em outro menor. Também pressupõe que toda a população é suscetível à doença. Os primeiros estudos sobre o comportamento do Covid-19 em Wuhan estimaram o R0 médio entre 2,2 e 2,7, enquanto surtos de menor escala como o que ocorreu a bordo do Diamond Princess tiveram um R0 estimado em 2,2. Outros estudos sugerem que valores tão baixos quanto 1,5 e tão altos quanto 3,8 eram possíveis. Nick Evershed and Andy Ball, (2020)

Mas o R0 não é o único número importante. O número efetivo de reprodução, R, é um valor que leva em consideração a suscetibilidade da população. Uma única pessoa portando o vírus no meio a uma população de 1000 pessoas, com um valor de maior de 1 a população e totalmente susceptível e a infeção pode se espalhar rapidamente. Acontece que algumas pessoas não são suscetíveis a infeção por causa da imunidade natural ou através da vacinação ou que já tenham sido previamente infetadas ou se a transmissão do vírus e coibida por parte da população estar isolada assim o valor de R diminui a transmissão e incompleta e reduzida. A redução de R abaixo de 1 corta a expansão e cortada e isto em general ajuda aos sistemas de saúde a processar melhor o influxo de pacientes.


Taxa de isolamento (%) e o percentual da população que está isolada ou em quarentena, pode ser estabelecido a traves de uma amostragem de presença de pessoas nas ruas utilizando equipamentos de proteção individual ou contagem casa a casa.

Taxa de susceptibilidade (%) indica se uma pessoa pode ser infectada e diminui com vacinação ou imunidade adquirida através de infecção. Esta pode ser calculada a partir da relação entre a população total do município e o número de infectados contabilizados através de teste de PCR, serológica e ainda o quadro clínico característico da doença.

Outra variável e quão mortal e a enfermidade provocada pelo vírus algumas enfermidades como Ebola tem R0 menor que outras doenças como Covid-19 porem tem uma alta taxa de mortalidade (%)  A taxa estimada de fatalidade para o Covid-19 varia novamente, dependendo da localização e da situação, e particularmente do nível de teste que está sendo realizado. No início do surto na China, por exemplo, um relatório colocou a taxa de mortalidade de casos em 2,3%. Na Coréia do Sul, o vírus tem uma taxa de mortalidade estimada em 1,2%. No Amazonas a taxa de mortalidade está neste momento em 7,981% segundo dados da FVS. Brasil no dia 27/04/2020 tinha 63100 doentes e   4286 obitos para uma taxa de mortalidade nacional de 5.4%.

Utilizando número básico de reprodução médio do Covid-19  Ro de 2,7, a taxa de mortalidade de 7,981% da FVS para 24/04/2020 em tudo o Estado do Amazonas, a taxa de suscetibilidade de cerca de 60% já que a população de Tabatinga não tem imunidade natural, nem está vacinada e não tem imunidade, e a taxa de isolamento arbitraria de 40%,  pode definir os limites para diferentes valores e ver o resultado usando um modelo simplificado. A realidade das pandemias é muito mais complexa, mas isso demonstra os conceitos básicos subjacentes à propagação de doenças. Esse modelo usa uma população hipotética de 1.000 pessoas para visualizar melhor a proporção de infecções e mortes e assume que todas as pessoas podem entrar em contato com todas as outras pessoas da população. A população de Tabatinga por exemplo e de 65844 habitantes e 1000 seriam o 1,5% da população local.

Nesse modelo, (36%) 365 pessoas do grupo foi infectado em comparação com (59,81%) da população 598 pessoas, se nenhuma estratégia de isolamento tivesse sido implementada. 30 pessoas morreram (3%) do grupo. Susceptível população: 598 ind., Infectados: 348 ind., óbitos: 29 ind. e R0: 2.79. Sem uma estratégia de isolamento, seriam necessárias 5,71 fases para todos os membros suscetíveis deste grupo (598 pessoas) serem infectados. O período de fase do vírus Covid-19 é entre cinco e seis dias, 34,26 dias.

Considerando o total de 65844 habitantes (100%) de Tabatinga os números seriam se nada for feito para controlar a expansão do vírus na comunidade assim 1975,32 óbitos, 39374,712 não infectados, 24362,28 infectados para o total. Daí a importância de realizar a pesquisa sobre formas reduzir a suscetibilidade da população ao vírus mediante comunicação assertiva, isolamento e limpeza extrema.

Dividindo estes números em 30 dias seria assim: 65,8 óbitos/dia, 1312,49 não infectados/dia, 812,076 infectados/dia e 11531,34 total por dia. Por fase que corresponde a 1 semana total de fase 5,71, 345,9404553    mortos/semana, 6895,74641       não infectados/semana, 4266,598949    infectado/sem., e 11531,34851  total/sem., para o município de Tabatinga. Como essa previsão se relaciona com a capacidade do sistema de saúde municipal foge ao escopo desta pesquisa.
A realidade atual da curva da epidemia em Tabatinga para o período de 13/03/2020 a 25/04/2020 é assim: 3 óbitos, 54 casos confirmados através de teste PCR ou serológico, para uma taxa de mortalidade de 5,55% menor do registrada pela FVS de 7,9 para o estado do Amazonas. Óbitos ocorridos no ano de 2018 em Tabatinga por lugar de residência do falecido 258 pessoas, uma média 21,5 de ind./mês e 0,71 pessoas/ dia, na média morre 1 pessoa por dia em Tabatinga ou seja que só a partir de 23 de abril que o número de óbitos afastou-se da média anual passando a 2 e 3 ind./dia.            Desses 258 obitos 27 foram por doenças do aparelho respiratório 10% do total sem ser a Covid-19.

Referências Covid-19


The effect of control strategies to reduce social mixing on outcomes of the COVID-19 epidemic in Wuhan, China: a modelling study.  Kiesha Prem*, Yang Liu*, Timothy W Russell, Adam J Kucharski, Rosalind M Eggo, Nicholas Davies, Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases COVID-19 Working Group†, Mark Jit, Petra Klepac


Pre-emptive low cost social distancing and enhanced hygiene implemented before local COVID-19 transmission could decrease the number and severity of cases.  Dalton CB1, Corbett SJ2, Katelaris AL3. 

           
Modeling infectious disease dynamics By Sarah Cobey Department of Ecology & Evolution, University of Chicago, Chicago, IL, USA. Email: cobey@uchicago.edu The spread of the coronavirus SARS-CoV-2 has predictable features.


Handbook of COVID-19 Prevention and treatment. The first affiliated hospital, Zheijang University School of medicine compiled according to clinical experience.  https://pdf-intl.alicdn.com/Handbook%20of%20COVID-19%20Prevention%20and%20Treatment%20%28Standard%29%20v2.pdf?spm=a3c0i.14138300.8102420620.download.5da1647ftzDp0n&file=Handbook%20of%20COVID9%20Prevention%20and%20Treatment%20%28Standard%29%20v2.pdf. Acesso 27/04/2020.


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